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Enregistrement W2006282544 · doi:10.1074/jbc.275.5.3675

Expression of a Human β-Globin Transgene in Mice with the CACC Motif and Upstream Sequences Deleted from the Promoter Still Depends on Erythroid Krüppel-like Factor

2000· article· en· W2006282544 sur OpenAlexaff
Louis-Georges Guy, Nathalie Delvoye, Lee Wall

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyTransgeneBiologyGenePromoterReporter geneGlobinGene expressionTranscription factorTransfectionTranscription (linguistics)Regulation of gene expressionRegulatory sequenceGenetically modified mouseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mice in which the erythroid Krüppel-like Factor (EKLF) gene is inactivated die in fetal life due to down-regulation of the beta-globin gene. Results have suggested that EKLF functions through the proximal CACC motif of the beta-globin promoter. For example, natural mutations of this element that fail to bind EKLF give reduced gene expression and the ability of EKLF to activate reporter genes in co-transfection assays is dependent on an intact CACC. Here, removal of the CACC motif and upstream promoter sequences from the beta-globin gene resulted in reduced expression in transgenic mice. However, breeding onto an EKLF-/- background demonstrated that a CACC-less beta-globin transgene remains highly dependent on EKLF. Hence, although the beta-globin gene partly depends on the proximal CACC motif for expression, it is unlikely that the major mechanism of gene activation by EKLF is through this element. We also show that a lacZ reporter gene linked to the beta-globin promoter, with or without the CACC box present, is actually expressed higher in EKLF-/- fetuses than in wild type animals, suggesting that EKLF may be able to act as an inhibitor of transcription with certain transgene configurations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,478

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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