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Enregistrement W2006393322 · doi:10.1074/jbc.m111.246983

Structural Basis of Activation of Bitter Taste Receptor T2R1 and Comparison with Class A G-protein-coupled Receptors (GPCRs)

2011· article· en· W2006393322 sur OpenAlexafffund
Nisha Singh, Sai P. Pydi, Jasbir Upadhyaya, Prashen Chelikani

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesManitoba Health Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésG protein-coupled receptorTransmembrane domainReceptorTransmembrane proteinAmino acidAgonistBiochemistryProtein structurePeptide sequenceMutantStructural motifBiologyChemistryStereochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human bitter taste receptors (T2Rs) are non-Class A members of the G-protein-coupled receptor (GPCR) superfamily, with very limited structural information. Amino acid sequence analysis reveals that most of the important motifs present in the transmembrane helices (TM1-TM7) of the well studied Class A GPCRs are absent in T2Rs, raising fundamental questions regarding the mechanisms of activation and how T2Rs recognize bitter ligands with diverse chemical structures. In this study, the bitter receptor T2R1 was used to systematically investigate the role of 15 transmembrane amino acids in T2Rs, including 13 highly conserved residues, by amino acid replacements guided by molecular modeling. Functional analysis of the mutants by calcium imaging analysis revealed that replacement of Asn-66(2.65) and the highly conserved Asn-24(1.50) resulted in greater than 90% loss of agonist-induced signaling. Our results show that Asn-24(1.50) plays a crucial role in receptor activation by mediating an hydrogen bond network connecting TM1-TM2-TM7, whereas Asn-66(2.65) is essential for binding to the agonist dextromethorphan. The interhelical hydrogen bond between Asn-24(1.50) and Arg-55(2.54) restrains T2R receptor activity because loss of this bond in I27A and R55A mutants results in hyperactive receptor. The conserved amino acids Leu-197(5.50), Ser-200(5.53), and Leu-201(5.54) form a putative LXXSL motif which performs predominantly a structural role by stabilizing the helical conformation of TM5 at the cytoplasmic end. This study provides for the first time mechanistic insights into the roles of the conserved transmembrane residues in T2Rs and allows comparison of the activation mechanisms of T2Rs with the Class A GPCRs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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