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Enregistrement W2006514118 · doi:10.1074/jbc.m114.598094

The Role of Palmitoylation for Protein Recruitment to the Inner Membrane Complex of the Malaria Parasite

2014· article· en· W2006514118 sur OpenAlexafffund
Johanna Wetzel, Susann Herrmann, Lakshmipuram S. Swapna, Dhaneswar Prusty, Arun T. John Peter, Maya Kono, Sidharth Saini, Srinivas Nellimarla, Tatianna Wai Ying Wong, Louisa Wilcke, Olivia Ramsay, Ana Cabrera, Laura Biller, Dorothee Heincke, Karen Mossman, Tobias Spielmann, Christian Ungermann, John Parkinson, Tim‐Wolf Gilberger

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPalmitoylationBiologyPlasmodium falciparumMyristoylationParasite hostingMembrane proteinCell biologyPeripheral membrane proteinCytoplasmIntegral membrane proteinBiochemistryMembraneMalariaEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To survive and persist within its human host, the malaria parasite Plasmodium falciparum utilizes a battery of lineage-specific innovations to invade and multiply in human erythrocytes. With central roles in invasion and cytokinesis, the inner membrane complex, a Golgi-derived double membrane structure underlying the plasma membrane of the parasite, represents a unique and unifying structure characteristic to all organisms belonging to a large phylogenetic group called Alveolata. More than 30 structurally and phylogenetically distinct proteins are embedded in the IMC, where a portion of these proteins displays N-terminal acylation motifs. Although N-terminal myristoylation is catalyzed co-translationally within the cytoplasm of the parasite, palmitoylation takes place at membranes and is mediated by palmitoyl acyltransferases (PATs). Here, we identify a PAT ( Pf DHHC1) that is exclusively localized to the IMC. Systematic phylogenetic analysis of the alveolate PAT family reveals Pf DHHC1 to be a member of a highly conserved, apicomplexan-specific clade of PATs. We show that during schizogony this enzyme has an identical distribution like two dual-acylated, IMC-localized proteins ( Pf ISP1 and Pf ISP3). We used these proteins to probe into specific sequence requirements for IMC-specific membrane recruitment and their interaction with differentially localized PATs of the parasite.Recruitment of peripheral proteins to the inner membrane complex (IMC) of the malaria parasite can be mediated by N-terminal acylation. Results Characterization of substrate determinants and identification of an IMC-localized palmitoyl acyltransferase Pf DHHC1. Conclusion Residues close to palmitoylation sites interfere with specific IMC recruitment. Pf DHHC1 represents an apicomplexan-specific PAT. Significance Dissection of palmitoylation for protein recruitment to the inner membrane complex in P. falciparum .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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