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Enregistrement W2006592777 · doi:10.1371/journal.pone.0118794

The C-Terminal Sequence of IFITM1 Regulates Its Anti-HIV-1 Activity

2015· article· en· W2006592777 sur OpenAlexafffund
Rui Jia, Shilei Ding, Qinghua Pan, Shan‐Lu Liu, Wentao Qiao, Chen Liang

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyMutantViral entryViral envelopeTransmembrane proteinGlycoproteinAmino acidPeptide sequenceVirologySubcellular localizationTransmembrane domainVirusCell biologyMolecular biologyViral replicationBiochemistryCytoplasmGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interferon-inducible transmembrane (IFITM) proteins inhibit a wide range of viruses. We previously reported the inhibition of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) strain BH10 by human IFITM1, 2 and 3. It is unknown whether other HIV-1 strains are similarly inhibited by IFITMs and whether there exists viral countermeasure to overcome IFITM inhibition. We report here that the HIV-1 NL4-3 strain (HIV-1NL4-3) is not restricted by IFITM1 and its viral envelope glycoprotein is partly responsible for this insensitivity. However, HIV-1NL4-3 is profoundly inhibited by an IFITM1 mutant, known as Δ(117-125), which is deleted of 9 amino acids at the C-terminus. In contrast to the wild type IFITM1, which does not affect HIV-1 entry, the Δ(117-125) mutant diminishes HIV-1NL4-3 entry by 3-fold. This inhibition correlates with the predominant localization of Δ(117-125) to the plasma membrane where HIV-1 entry occurs. In spite of strong conservation of IFITM1 among most species, mouse IFITM1 is 19 amino acids shorter at its C-terminus as compared to human IFITM1 and, like the human IFITM1 mutant Δ(117-125), mouse IFITM1 also inhibits HIV-1 entry. This is the first report illustrating the role of viral envelope protein in overcoming IFITM1 restriction. The results also demonstrate the importance of the C-terminal region of IFITM1 in modulating the antiviral function through controlling protein subcellular localization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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