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Enregistrement W2006679756 · doi:10.1016/j.neuroimage.2015.04.025

The Center for Integrated Molecular Brain Imaging (Cimbi) database

2015· article· en· W2006679756 sur OpenAlexaff
Gitte M. Knudsen, P.S. Jensen, David Erritzøe, William F.C. Baaré, Anders Ettrup, Patrick M. Fisher, Nic Gillings, Hanne D. Hansen, Lars Kai Hansen, Steen Gregers Hasselbalch, Susanne Henningsson, Matthias M. Herth, Klaus K. Holst, Pernille Iversen, Lars Vedel Kessing, Julian Macoveanu, Kathrine Skak Madsen, Erik Lykke Mortensen, Finn Årup Nielsen, Olaf B. Paulson, Hartwig R. Siebner, Dea Siggaard Stenbæk, Claus Svarer, Terry L. Jernigan, Stephen C. Strother, Vibe G. Frøkjær

Notice bibliographique

RevueNeuroImage · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensBaycrest Hospital
Organismes subventionnairesH. Lundbeck A/SRigshospitaletLundbeckfondenNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésBiobankDatabaseNeuroimagingSerotonergicPsychologyMedicineComputer scienceNeuroscienceBioinformaticsInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We here describe a multimodality neuroimaging containing data from healthy volunteers and patients, acquired within the Lundbeck Foundation Center for Integrated Molecular Brain Imaging (Cimbi) in Copenhagen, Denmark. The data is of particular relevance for neurobiological research questions related to the serotonergic transmitter system with its normative data on the serotonergic subtype receptors 5-HT1A, 5-HT1B, 5-HT2A, and 5-HT4 and the 5-HT transporter (5-HTT), but can easily serve other purposes. The Cimbi database and Cimbi biobank were formally established in 2008 with the purpose to store the wealth of Cimbi-acquired data in a highly structured and standardized manner in accordance with the regulations issued by the Danish Data Protection Agency as well as to provide a quality-controlled resource for future hypothesis-generating and hypothesis-driven studies. The Cimbi database currently comprises a total of 1100 PET and 1000 structural and functional MRI scans and it holds a multitude of additional data, such as genetic and biochemical data, and scores from 17 self-reported questionnaires and from 11 neuropsychological paper/computer tests. The database associated Cimbi biobank currently contains blood and in some instances saliva samples from about 500 healthy volunteers and 300 patients with e.g., major depression, dementia, substance abuse, obesity, and impulsive aggression. Data continue to be added to the Cimbi database and biobank.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,105

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0080,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0310,029

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations131
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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