Lodgepole pine, jack pine, and their hybrids: molecular markers reveal mountain pine beetle host-range expansion into jack pine of the boreal forest
Notice bibliographique
Résumé
Background Lodgepole pine (Pinus contorta Dougl. ex Loud. var. latifolia) is found in western North America, extending from the Yukon into British Columbia and Washington, and along the Rocky Mountains and eastern slopes to Colorado [1]. Jack pine (Pinus banksiana Lamb.) is a closely related species found east of the Rockies, mainly in Canada’s boreal forest from the Northwest Territories to Quebec [1]. Lodgepole and jack pine ranges overlap in northern Alberta and the Northwest Territories, where these species hybridize (Fig. 1). In the absence of reliable molecular markers, morphological characteristics are commonly used to distinguish lodgepole pine, jack pine and hybrids. However, hybrids and pure species can be difficult to visually distinguish, particularly at the presumed periphery of the hybrid zone, which is poorly described. Mountain pine beetle (MPB; Dendroctonus ponderosae Hopkins) is indigenous to western North America. In the current MPB outbreak, more than 14 million hectares of mainly lodgepole pine forests have sustained MPB-caused mortality in British Columbia alone [2]. Following MPB long range dispersal into northwestern Alberta in 2006, MPB has continued its apparently unprecedented eastward spread into the lodgepole x jack pine hybrid zone of Alberta (Fig. 1). To better define this hybrid zone, we developed microsatellite and SNP markers that distinguish the pure species from hybrids. We then used the microsatellite markers to test the hypothesis that the MPB epidemic has spread into jack pine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».