MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2006739245 · doi:10.4161/pri.20675

The P’s and Q’s of cellular PrP-Aβ interactions

2012· article· en· W2006739245 sur OpenAlexafffund
David Westaway, Jack H. Jhamandas

Notice bibliographique

RevuePrion · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Prion Research InstituteNetworks of Centres of Excellence of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeurodegenerationGene isoformDiseaseBiologyNeurosciencePrion proteinAmyloid (mycology)ScrapieVirologyMedicineGeneGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prion disease research has opened up the "black-box" of neurodegeneration, defining a key role for protein misfolding wherein a predominantly alpha-helical precursor protein, PrP (C), is converted to a disease-associated, β-sheet enriched isoform called PrP (Sc). In Alzheimer disease (AD) the Aβ peptide derived from the β-amyloid precuror protein APP folds in β-sheet amyloid. Early thoughts along the lines of overlap may have been on target, (1) but were eclipsed by a simultaneous (but now anachronistic) controversy over the role of PrP (Sc) in prion diseases. (2) (,) (3) Nonetheless, as prion diseases such as Creutzfeldt-Jakob Disease (CJD) are themselves rare and can include an overt infectious mode of transmission, and as familial prion diseases and familial AD involve different genes, an observer might reasonably have concluded that prion research could occasionally catalyze ideas in AD, but could never provide concrete overlaps at the mechanistic level. Surprisingly, albeit a decade or three down the road, several prion/AD commonalities can be found within the contemporary literature. One important prion/AD overlap concerns seeded spread of Aβ aggregates by intracerebral inoculation much like prions, (4) and, with a neuron-to-neuron 'spreading' also reported for pathologic forms of other misfolded proteins, Tau (5) (,) (6) and α-synuclein in the case of Parkinson Disease. (7) (,) (8) The concept of seeded spread has been discussed extensively elsewhere, sometimes under the rubric of "prionoids" (9), and lies outside the scope of this particular review where we will focus upon PrP (C). From this point the story can now be subdivided into four strands of investigation: (1) pathologic effects of Aβ can be mediated by binding to PrP (C), (10) (2) the positioning of endoproteolytic processing events of APP by pathologic (β-cleavage + γ-cleavage) and non-pathologic (α-cleavage + γ-cleavage) secretase pathways is paralleled by seemingly analogous α- and β-like cleavage of PrP (C) (Fig. 1) (3) similar lipid raft environments for PrP (C) and APP processing machinery, (11) (-) (13) and perhaps in consequence, overlaps in repertoire of the PrP (C) and APP protein interactors ("interactomes"), (14) (,) (15) and (4) rare kindreds with mixed AD and prion pathologies. (16) Here we discuss confounds, consensus and conflict associated with parameters that apply to these experimental settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,440
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePrionMême sujetPrion Diseases and Protein MisfoldingTravaux en français237 207