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Enregistrement W2006825579 · doi:10.1094/mpmi.2004.17.8.865

Changes in Gene Expression in Canola Roots Induced by ACC-Deaminase-Containing Plant-Growth-Promoting Bacteria

2004· article· en· W2006825579 sur OpenAlexaff
Nikos Hontzeas, Saleema S. Saleh, Bernard R. Glick

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant-Microbe Interactions · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneGene expressionMutantMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The technique of RNA arbitrarily primed-polymerase chain reaction (RAP-PCR) was used to study changes in gene expression over time in canola roots treated with the 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase-containing plant-growth-promoting bacterium Enterobacter cloacae UW4 and to compare the changes with those in a mutant of E. cloacae UW4 in which the ACC deaminase structural gene acdS was replaced by homologous recombination with acdS with an intentional knockout containing a tetracycline resistance gene. Genes that were either up- or down-regulated over a three-day period in canola plants treated with wild-type or mutant bacteria were isolated, cloned, and sequenced; all appeared to have high homology with Arabidopsis thaliana genes. The upregulated genes included a cell division cycle protein 48 homolog and a eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 7 gene homolog. The downregulated genes included one encoding a glycine-rich RNA binding protein with a function in RNA processing or binding during ethylene-induced stress, which is expressed only in roots, and another gene thought to be involved in a defense signaling pathway. All RAP-PCR results were verified using Northern blotting. These data, indicate that roots isolated from canola seeds treated with the ACC deaminase-producing E. cloacae UW4 upregulate genes involved in cell division and proliferation but down-regulate stress genes. This data is in agreement with a model in which ACC deaminase-containing plant-growth-promoting bacteria reduce plant stress and induce root elongation and proliferation in plants, largely by lowering ethylene levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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