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Enregistrement W2006889231 · doi:10.1080/10934520802659620

Computational approaches may underestimate pK<sub><i>a</i></sub>values of longer-chain perfluorinated carboxylic acids: Implications for assessing environmental and biological effects

2009· article· en· W2006889231 sur OpenAlexaff
Sierra Rayne, Kaya Forest, Ken J. Friesen

Notice bibliographique

RevueJournal of Environmental Science and Health Part A · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePer- and polyfluoroalkyl substances research
Établissements canadiensOkanagan CollegeUniversity of Winnipeg
Organismes subventionnairesScheme for Promotion of Academic and Research CollaborationUniversity of Birmingham
Mots-clésBranching (polymer chemistry)CarboxylateChemistryLong chainChain (unit)Linear relationshipA valueStereochemistryMathematicsOrganic chemistryStatisticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acidity constants were calculated using the semiempirical PM6 pK(a) estimation method for all C(2) through C(9) perfluoroalkyl carboxylate (PFCA) congeners and the straight-chain C(10) through C(13) isomers. According to the PM6 estimates, the linear congeners within each PFCA homologue group have the highest pK(a) values by up to 6 units depending on the degree of branching in the perfluoroalkyl chain. In general, the higher the degree of branching in the perfluoroalkyl chain within a homologue group, the lower the estimated pK(a) value. When the branching is closest to the terminal carboxylate group, the effect on the calculated pK(a) is greatest. Although the PM6 calculated pK(a) values agree well with previously reported estimates for selected linear PFCA congeners using the SPARC and COSMOtherm approaches, all computational approaches only show good agreement with reported experimental values for short chain PFCAs (C(2) through C(5)). Increasing divergences are observed between calculated and experimental results by up to several pK(a) units as the perfluoroalkyl chain length increases beyond C(5). The findings demonstrate a need for additional experimental pK(a) measurements for an expanded set of both linear and branched PFCA congeners to confirm previous experimental reports that are potentially in error, and upon which to calibrate existing computational methods and environmental, toxicological, and waste treatment method models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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