Non-Invasive Cytology Brush PCR for the Diagnosis and Causative Species Identification of American Cutaneous Leishmaniasis in Peru
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Traditional methods of detecting Leishmania from cutaneous lesions involve invasive diagnostic procedures, such as scrapings, which cause discomfort, require technical expertise, and carry risks of invasive procedures. We compared the performance of 2 novel, molecular-based non-invasive methods for the diagnosis of cutaneous leishmaniasis (CL). METHODS: Consecutive patients presenting to the Leishmania Clinic at the Hospital Nacional Cayetano Heredia were enrolled. PCR was performed on filter paper lesion impressions (FPLIs), cytology brushes, and lancets for detection of Leishmania DNA. Smears from lesion scrapings and leishmanin skin test were also performed. Outcome measures were sensitivity and specificity. Composite reference standard was any 2 of 5 tests positive. Species identification was performed by PCR assays of positive specimens. RESULTS: Ninety patients with 129 lesions were enrolled, 117 of which fulfilled reference criteria for a diagnosis of CL. Of these 117 lesions, 113 were positive by PCR of lancets used for lesion scrapings versus 116 by PCR of FPLIs (p=0.930) or 116 by PCR of cytology brushes (p=0.930). Sensitivity and specificity of PCR on lancets were 96.6% [95% CI 93.3-99.9%] and 100%, respectively. Sensitivity and specificity of FPLI PCR were 99.1% [95% CI 97.4-100%] and 100%, respectively. Sensitivity and specificity of cytology brush PCR were 99.1% [95% CI 97.4-100%] and 100%, respectively. Giemsa-stained lesion smear and leishmanin skin test had inferior sensitivities at 47.9% [95% CI 38.9-57.0%] and 82.3% [95% CI 73.9-90.7%], respectively, compared to PCR of invasive or non-invasive specimens (p<0.001). CONCLUSIONS: Cytology brush PCR constitutes a sensitive and specific alternative to traditional diagnostic assays performed on invasive specimens such as lesion scrapings. It performs comparatively to non-invasive FPLI PCR. This novel, rapid, and well-tolerated method has the potential for widespread use in the field and in pediatric populations where traditional specimen collection is difficult.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».