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Enregistrement W2006974937 · doi:10.1016/j.scienta.2012.02.017

Genetic diversity analysis based on ISSR, RAPD and SSR among Turkish Apricot Germplasms in Iran Caucasian eco-geographical group

2012· article· en· W2006974937 sur OpenAlexfundno aff
Kadir Yılmaz, S. Paydas-Kargi, Yıldız Doğan, Salih Kafkas

Notice bibliographique

RevueScientia Horticulturae · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Physiology and Cultivation Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of British Columbia
Mots-clésUPGMARAPDGermplasmGenetic diversityBiologyDendrogramPrunus armeniacaCultivarGenetic markerMicrosatelliteBotanyGenetic relationshipGenetic variationHorticultureGeneticsGeneAlleleMedicinePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

► Genetic diversity was evaluated among Turkish apricot germplams. ► There was high level of variation in apricot accessions. ► Apricots were separated in different groups according to their geographic origin. ► Obtained data can use breeding programs to develop new apricot varieties for breeders. Molecular markers have been used for genetic study and identification of cultivars belonging to different fruit species for a long time. In this study ISSR, RAPD and SSR markers were used to evaluate genetic variation and relationships among 95 apricot and one plumcot cultivar located in the Apricot Germplasm Repository in Malatya, Turkey. All three marker systems distinguished the apricots in various levels. The highest polymorphism (98%) was obtained with simple sequence repeat (SSR), followed by inter-simple sequence repeat (ISSR) (88%) and randomly amplified polimorfic DNA (RAPD) markers (77%). The similarity values were between 0.49 and 0.94 among apricot cultivars. ‘Sekerpare Igdir’ and ‘Sekerpare Benzeri’ were the most similar (0.94). The UPGMA dendrogram constructed using combined data of three marker systems separated the genotypes into two main clusters: one cluster included genotypes originating from Malatya and the other regions, and the second cluster contained cultivars mostly from Mediterranean region. The plumcot cv. ‘Kayisi Erigi’ was outgroup. These results supported that apricots in Turkey indicated considerable genetic diversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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