Genetic diversity analysis based on ISSR, RAPD and SSR among Turkish Apricot Germplasms in Iran Caucasian eco-geographical group
Notice bibliographique
Résumé
► Genetic diversity was evaluated among Turkish apricot germplams. ► There was high level of variation in apricot accessions. ► Apricots were separated in different groups according to their geographic origin. ► Obtained data can use breeding programs to develop new apricot varieties for breeders. Molecular markers have been used for genetic study and identification of cultivars belonging to different fruit species for a long time. In this study ISSR, RAPD and SSR markers were used to evaluate genetic variation and relationships among 95 apricot and one plumcot cultivar located in the Apricot Germplasm Repository in Malatya, Turkey. All three marker systems distinguished the apricots in various levels. The highest polymorphism (98%) was obtained with simple sequence repeat (SSR), followed by inter-simple sequence repeat (ISSR) (88%) and randomly amplified polimorfic DNA (RAPD) markers (77%). The similarity values were between 0.49 and 0.94 among apricot cultivars. ‘Sekerpare Igdir’ and ‘Sekerpare Benzeri’ were the most similar (0.94). The UPGMA dendrogram constructed using combined data of three marker systems separated the genotypes into two main clusters: one cluster included genotypes originating from Malatya and the other regions, and the second cluster contained cultivars mostly from Mediterranean region. The plumcot cv. ‘Kayisi Erigi’ was outgroup. These results supported that apricots in Turkey indicated considerable genetic diversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».