Giant virus with a remarkable complement of genes infects marine zooplankton
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
As major consumers of heterotrophic bacteria and phytoplankton, microzooplankton are a critical link in aquatic foodwebs. Here, we show that a major marine microflagellate grazer is infected by a giant virus, Cafeteria roenbergensis virus (CroV), which has the largest genome of any described marine virus (≈730 kb of double-stranded DNA). The central 618-kb coding part of this AT-rich genome contains 544 predicted protein-coding genes; putative early and late promoter motifs have been detected and assigned to 191 and 72 of them, respectively, and at least 274 genes were expressed during infection. The diverse coding potential of CroV includes predicted translation factors, DNA repair enzymes such as DNA mismatch repair protein MutS and two photolyases, multiple ubiquitin pathway components, four intein elements, and 22 tRNAs. Many genes including isoleucyl-tRNA synthetase, eIF-2γ, and an Elp3-like histone acetyltransferase are usually not found in viruses. We also discovered a 38-kb genomic region of putative bacterial origin, which encodes several predicted carbohydrate metabolizing enzymes, including an entire pathway for the biosynthesis of 3-deoxy-d-manno-octulosonate, a key component of the outer membrane in Gram-negative bacteria. Phylogenetic analysis indicates that CroV is a nucleocytoplasmic large DNA virus, with Acanthamoeba polyphaga mimivirus as its closest relative, although less than one-third of the genes of CroV have homologs in Mimivirus. CroV is a highly complex marine virus and the only virus studied in genetic detail that infects one of the major groups of predators in the oceans.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle