Schimke immunoosseous dysplasia: suggestions of genetic diversity
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Schimke immunoosseous dysplasia (SIOD), which is characterized by prominent spondyloepiphyseal dysplasia, T-cell deficiency, and focal segmental glomerulosclerosis, is a panethnic autosomal recessive multisystem disorder with variable expressivity. Biallelic mutations in switch/sucrose nonfermenting (swi/snf) related, matrix-associated, actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a-like 1 (SMARCAL1) are the only identified cause of SIOD. However, among 72 patients from different families, we identified only 38 patients with biallelic mutations in the coding exons and splice junctions of the SMARCAL1 gene. This observation, the variable expressivity, and poor genotype-phenotype correlation led us to test several hypotheses including modifying haplotypes, oligogenic inheritance, or locus heterogeneity in SIOD. Haplotypes associated with the two more common mutations, R820H and E848X, did not correlate with phenotype. Also, contrary to monoallelic SMARCAL1 coding mutations indicating oligogenic inheritance, we found that all these patients did not express RNA and/or protein from the other allele and thus have biallelic SMARCAL1 mutations. We hypothesize therefore that the variable expressivity among patients with biallelic SMARCAL1 mutations arises from environmental, genetic, or epigenetic modifiers. Among patients without detectable SMARCAL1 coding mutations, our analyses of cell lines from four of these patients showed that they expressed normal levels of SMARCAL1 mRNA and protein. This is the first evidence for nonallelic heterogeneity in SIOD. From analysis of the postmortem histopathology from two patients and the clinical data from most patients, we propose the existence of endophenotypes of SIOD.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle