Holarctic phylogeography of the root vole (<i>Microtus oeconomus</i>): implications for late Quaternary biogeography of high latitudes
Notice bibliographique
Résumé
A species-wide phylogeographical study of the root vole (Microtus oeconomus) was performed using the whole 1140 base pair mitochondrial (mt) cytochrome b gene. We examined 83 specimens from 52 localities resulting in 65 unique haplotypes. Our results demonstrate that the root vole is divided into four main mtDNA phylogenetic lineages that seem to have largely allopatric distributions. Net divergence estimates (2.0-3.5%) between phylogroups, as well as relatively high nucleotide diversity estimates within phylogroups, indicate that the distinct phylogeographical structure was initiated by historical events that predated the latest glaciation. European root voles are divided into a Northern and a Central mtDNA phylogroup. The mtDNA data in concert with fossil records imply that root voles remained north of the classical refugial areas in southern Europe during the last glacial period. The currently fragmented populations in central Europe belong to a single mtDNA phylogroup. The Central Asian and the North European lineages are separated by the Ural Mountains, a phylogeographical split also found in collared lemmings (Dicrostonyx) and the common vole (M. arvalis). The Beringian lineage occurs from eastern Russia through Alaska to northwestern Canada. This distribution is congruent with the traditional boundaries of the Beringian refugium and with phylogeographical work on other organisms. In conclusion, similarities between the phylogeographical patterns in the root vole and other rodents, such as Arctic and subarctic lemmings, as well as more temperate vole species, indicate that late Quaternary geological and climatic events played a strong role in structuring northern biotic communities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».