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Enregistrement W2007173559 · doi:10.1089/jir.2011.0100

Glomulin: A Permissivity Factor for Vaccinia Virus Infection

2012· article· en· W2007173559 sur OpenAlexafffund
Ramtin Rahbar, Erin Rogers, Thomas T. Murooka, Thomas Kislinger, Eleanor N. Fish

Notice bibliographique

RevueJournal of Interferon & Cytokine Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPhosphorylationVacciniaMAPK/ERK pathwayImmunoprecipitationTyrosine phosphorylationEffectorVirologyVirusHost factorGene knockdownSignal transductionBiologyInfectivityCell biologyCancer researchCell cultureImmunologyAntibodyRecombinant DNABiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In earlier studies we provided evidence that vaccinia virus (VACV) phosphorylation-activation of host cell signaling effectors is critical for subsequent viral replication. In this report, using mass spectrometry-based proteomics, we have identified 387 host cell proteins that co-immunoprecipitate with VACV in infected, permissive PM1.CCR5 human T cells. Among these, glomulin was distinguishable based on its known interaction with a tyrosine kinase receptor, c-Met, its ability to become tyrosine-phosphorylated, and its association with signaling effectors. siRNA knockdown of glomulin expression in PM1.CCR5 T cells reduces VACV infection. Glomulin interacts with the inactive, nonphosphorylated form of c-MET. We demonstrate that treatment of PM1.CCR5 T cells with a c-Met phosphorylation inhibitor leads to a significant reduction in VACV infectivity. Additionally, inhibition of phosphorylation of c-Met abrogates VACV-inducible phosphorylation of Erk 1/2 and IRS-2, signaling effectors identified as critical for VACV infection. These data identify glomulin as a permissivity factor for VACV infection and as a potential therapeutic target for inhibition of VACV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,258
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,415
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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