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Enregistrement W2007180883 · doi:10.1136/jmg.39.6.407

Change in the penetrance of founder <i>BRCA1/2</i> mutations? A retrospective cohort study

2002· article· en· W2007180883 sur OpenAlexaffabout
William D. Foulkes

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityMcGill University Health CentreJewish General HospitalMontreal General Hospital
Organismes subventionnairesU.S. Department of Defense
Mots-clésPenetranceFounder effectGeneticsBreast cancerPopulationCohortMutationMedicineCancerAlleleOncologyBiologyInternal medicineHaplotypePhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There has been much discussion regarding the penetrance of breast cancer in BRCA1 / 2 mutation carriers (hereafter “carriers”). Both genetic and epigenetic factors could be influencing the reported penetrance estimates. We wanted to establish whether the penetrance of BRCA1 / 2 mutations is changing over time. To limit the genetic variability, we studied a cohort of 292 Ashkenazi Jewish (AJ) women diagnosed with first primary invasive breast cancer between 1 January 1980 and 1 November 1995 at a single Montreal Hospital, without regard to family history. All women were diagnosed at less than 65 years of age. Pathology blocks were identified from all women and the three AJ founder mutations in BRCA1 / 2 (185delAG, 5382insC ( BRCA1 ) and 6174delT ( BRCA2 )) were identified in archival samples using PCR based techniques described previously.1 We identified 41 (14%, 95% CI 10.2-18.6) BRCA1/2 carriers (31 in BRCA1 and 10 in BRCA2 ). The difference in mutation frequency between BRCA1 and BRCA2 carriers (10.6% v 3.4%) is statistically significant (Z=3.40, p=0.0007). Given that the population allele frequencies of AJ founder mutations in BRCA1 and BRCA2 are approximately equal (∼1%), this would suggest that BRCA1 has a higher penetrance than BRCA2 by age 65. This observation supports previous data from Canada.2 We then divided the data into quartiles by year of diagnosis and determined whether the proportion of mutation carriers was changing over time. The number of founder BRCA1 / 2 mutations per quartile of year of diagnosis increased from eight (11.0%) to 15 (20.5%) over the 15 year period of the study, and the χ2 p value for the trend in mean scores was 0.047 (table 1). This suggests that the penetrance of BRCA1 / 2 mutations to the age of 65 years is increasing. This is important, as previous studies of …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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