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Enregistrement W2007251599 · doi:10.1172/jci58818

TRAF6 is an amplified oncogene bridging the RAS and NF-κB pathways in human lung cancer

2011· article· en· W2007251599 sur OpenAlexafffund
Daniel T. Starczynowski, William W. Lockwood, Sophie Deléhouzée, Raj Chari, Joanna Węgrzyn, Megan Fuller, Ming‐Sound Tsao, Stephen Lam, Adi F. Gazdar, Wan L. Lam, Aly Karsan

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLung cancerCarcinogenesisOncogeneBiologyCancer researchSomatic cellCancerGene duplicationGeneGeneticsPathologyMedicineCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Somatic mutations and copy number alterations (as a result of deletion or amplification of large portions of a chromosome) are major drivers of human lung cancers. Detailed analysis of lung cancer-associated chromosomal amplifications could identify novel oncogenes. By performing an integrative cytogenetic and gene expression analysis of non-small-cell lung cancer (NSCLC) and small-cell lung cancer (SCLC) cell lines and tumors, we report here the identification of a frequently recurring amplification at chromosome 11 band p13. Within this region, only TNF receptor-associated factor 6 (TRAF6) exhibited concomitant mRNA overexpression and gene amplification in lung cancers. Inhibition of TRAF6 in human lung cancer cell lines suppressed NF-κB activation, anchorage-independent growth, and tumor formation. In these lung cancer cell lines, RAS required TRAF6 for its oncogenic capabilities. Furthermore, TRAF6 overexpression in NIH3T3 cells resulted in NF-κB activation, anchorage-independent growth, and tumor formation. Our findings show that TRAF6 is an oncogene that is important for RAS-mediated oncogenesis and provide a mechanistic explanation for the previously apparent importance of constitutive NF-κB activation in RAS-driven lung cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,169
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations174
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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