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Enregistrement W2007345250 · doi:10.1371/journal.pone.0038431

A Population-Based Cohort Study of Mycobacterium tuberculosis Beijing Strains: An Emerging Public Health Threat in an Immigrant-Receiving Country?

2012· article· en· W2007345250 sur OpenAlexafffundabout
Deanne Langlois-Klassen, Dennis Kunimoto, L. Duncan Saunders, Linda Chui, Jody Boffa, Dick Menzies, Richard Long

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthMcGill University Health CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaUniversity of AlbertaMcGill UniversityAlberta Health Services
Mots-clésBeijingMedicineTuberculosisMycobacterium tuberculosisPopulationSputumEpidemiologyPublic healthOutbreakDrug resistanceRetrospective cohort studyEnvironmental healthInternal medicineDemographyChinaVirologyPathologyMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Mycobacterium tuberculosis Beijing strains are frequently associated with tuberculosis outbreaks and drug resistance. However, contradictory evidence and limited study generalizability make it difficult to foresee if the emergence of Beijing strains in high-income immigrant-receiving countries poses an increased public health threat. The purpose of this study was to determine if Beijing strains are associated with high risk disease presentations relative to other strains within Canada. METHODS: This was a retrospective population-based study of culture-confirmed active TB cases in a major immigrant-receiving province of Canada in 1991 through 2007. Of 1,852 eligible cases, 1,826 (99%) were successfully genotyped. Demographic, clinical, and mycobacteriologic surveillance data were combined with molecular diagnostic data. The main outcome measures were site of disease, lung cavitation, sputum smear positivity, bacillary load, and first-line antituberculosis drug resistance. RESULTS: A total of 350 (19%) patients had Beijing strains; 298 (85%) of these were born in the Western Pacific. Compared to non-Beijing strains, Beijing strains were significantly more likely to be associated with polyresistance (aOR 1.8; 95% CI 1.0-3.3; p = 0.046) and multidrug-resistance (aOR 3.4; 1.0-11.3; p = 0.049). Conversely, Beijing strains were no more likely than non-Beijing strains to be associated with respiratory disease (aOR 1.3; 1.0-1.8; p = 0.053), high bacillary load (aOR 1.2; 0.6-2.7), lung cavitation (aOR 1.0; 0.7-1.5), immediately life-threatening forms of tuberculosis (aOR 0.8; 0.5-1.6), and monoresistance (aOR 0.9; 0.6-1.3). In subgroup analyses, Beijing strains only had a significant association with multidrug-resistant tuberculosis (aOR 6.1; 1.2-30.4), and an association of borderline significance with polyresistant tuberculosis (aOR 1.8; 1.0-3.5; p = 0.062), among individuals born in the Western Pacific. CONCLUSION: Other than an increased risk of polyresistant or multidrug-resistant tuberculosis, Beijing strains appear to pose no more of a public health threat than non-Beijing strains within a high-income immigrant-receiving country.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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