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Enregistrement W2007354430 · doi:10.1371/journal.pgen.0030185

Genetic Variation and Population Structure in Native Americans

2007· article· en· W2007354430 sur OpenAlexafffund
Sijia Wang, Cecil M. Lewis, Mattias Jakobsson, Sohini Ramachandran, Nicolas Ray, Gabriel Bedoya, Winston Rojas, María Victoria Parra, Julio A. Molina, Carla Gallo, Guido Mazzotti, Giovanni Poletti, Kim Hill, Ana Hurtado, Damian Labuda, William Klitz, Ramiro Barrantes, María Cátira Bortolini, Francisco M. Salzano, Maria Luiza Petzl‐Erler, Luiza Tamie Tsuneto, Elena Llop, Francisco Rothhammer, Laurent Excoffier, Marcus W. Feldman, Noah A. Rosenberg, Andrés Ruiz‐Linares

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRace, Genetics, and Society
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchUniversidad de AntioquiaDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS)University College LondonBurroughs Wellcome FundUniversity of MichiganAlfred P. Sloan FoundationNational Human Genome Research Institute
Mots-clésBiologyGenetic variationVariation (astronomy)Evolutionary biologyPopulationPopulation structureGeneticsPopulation geneticsComputational biologyHuman genetic variationGenomeDemographyHuman genomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We examined genetic diversity and population structure in the American landmass using 678 autosomal microsatellite markers genotyped in 422 individuals representing 24 Native American populations sampled from North, Central, and South America. These data were analyzed jointly with similar data available in 54 other indigenous populations worldwide, including an additional five Native American groups. The Native American populations have lower genetic diversity and greater differentiation than populations from other continental regions. We observe gradients both of decreasing genetic diversity as a function of geographic distance from the Bering Strait and of decreasing genetic similarity to Siberians--signals of the southward dispersal of human populations from the northwestern tip of the Americas. We also observe evidence of: (1) a higher level of diversity and lower level of population structure in western South America compared to eastern South America, (2) a relative lack of differentiation between Mesoamerican and Andean populations, (3) a scenario in which coastal routes were easier for migrating peoples to traverse in comparison with inland routes, and (4) a partial agreement on a local scale between genetic similarity and the linguistic classification of populations. These findings offer new insights into the process of population dispersal and differentiation during the peopling of the Americas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations632
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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