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Enregistrement W2007403241 · doi:10.1139/b08-046

Morphological, biological, and molecular characteristics of the diatom<i>Pseudo-nitzschia delicatissima</i>from the Canadian MaritimesThis paper is one of a selection of papers published in the Special Issue on Systematics Research.

2008· article· en· W2007403241 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueBotany · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensMount Allison UniversityFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésBiologyDiatomDNA barcodingInternal transcribed spacerCosmopolitan distributionEvolutionary biologySpecies complexGenBankEcologyZoologyPhylogenetic treeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Forty-six monoclonal cultures of the diatom Pseudo-nitzschia delicatissima (Cleve) Heiden were isolated from coastal waters of Eastern Canada. Of these, 12 clones were successfully sexualized. The range of their morphological and genetic divergence was used as a reference for clones whose sexual identity remains unknown. All characters that were examined, including valve morphology, the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region, and mitochondrial cytochrome c oxidase (cox1) sequences, showed a high degree of similarity within and between mating and nonsexualized clones. Within the 638 bp long aligned fragment in the ITS region, only five variable sites were found and just two were found within the 576 bp fragment of cox1 near the 5′ terminus of the gene. Our own data and those retrieved from GenBank suggest that the northern North Atlantic is populated by a single metapopulation of genetically very similar P. delicatissima, as determined using the ITS sequence of the epitype of the species. The ITS region of our clones was distinct from ITS-types present in isolates that we will refer to as P. delicatissima-like diatoms from the Mediterranean Sea and other low latitude Atlantic sites, thereby providing a means to discriminate between otherwise morphologically indistinguishable (cryptic) species. Such a distribution pattern suggests different physiological and environmental requirements for mating optima. This work furthers our understanding of the relationship between biological, molecular, and morphological species boundaries in diatoms and their ecology, and contributes to evaluation of the utility of ITS and cox1 sequences in DNA barcoding of diatoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,902
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle