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Enregistrement W2007432617 · doi:10.5588/ijtld.13.0932

Crohn's disease susceptibility variants in Colombian tuberculosis patients

2013· article· en· W2007432617 sur OpenAlexaff
David Sánchez‐Infantes, Christine Lefebvre, Luis F. García, John D. Rioux, Luis F. Barrera

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Tuberculosis and Lung Disease · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMontreal Heart InstituteCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilUniversidad de AntioquiaHarvard University
Mots-clésMedicineSingle-nucleotide polymorphismCrohn's diseaseSNPLinkage disequilibriumGenotypingTuberculosisDiseaseSNP genotypingCase-control studyGenetic associationImmunologyGenetic predispositionMycobacterium tuberculosisGenome-wide association studyGenotypeGeneticsInternal medicinePathologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The molecular basis of genetic predisposition to pulmonary tuberculosis (PTB) in adults remains largely elusive. A chronic granulomatous inflammatory reaction is one of the main characteristics of the immune response to TB; however, a similar reaction is observed in other diseases, such as Crohn's disease. OBJECTIVE: To assess the association of genetic polymorphisms previously associated with Crohn's disease and PTB in a Colombian population of PTB patients and controls. DESIGN: A case-control study was performed among 500 newly diagnosed PTB patients and 320 healthy control subjects. Thirty-one single nucleotide polymorphisms (SNPs) identified in a previous meta-analysis of genome-wide association studies of Crohn's disease were used for genotyping using MassARRAY technology. RESULTS: In this study, we identified an association with borderline significance (P = 0.0009433 and P = 0.029 after multiple testing by Bonferroni's correction) of SNP rs10995271 with PTB. SNP rs10995271 is in linkage disequilibrium with SNPs belonging to the zinc finger protein (ZNF365) gene. CONCLUSIONS: Our results suggest that human PTB shares a genetic basis with Crohn's disease, and that SNPs in the ZNF365 gene would have a role in the occurrence of chronic granulomatous inflammatory reaction in TB as well as Crohn's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,077

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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