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Enregistrement W2007470688 · doi:10.1002/em.20289

Consensus recommendations to promote and advance predictive systems toxicology and toxicogenomics

2007· article· en· W2007470688 sur OpenAlexaffabout
Michael D. Waters, Carole L. Yauk

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene expression and cancer classification
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésToxicogenomicsData scienceBiologyComputer scienceEngineering ethicsToxicologyEngineeringGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The number of high throughput -omics technologies continues to grow. Toxicogenomic application of these technologies is poised to greatly influence current regulatory toxicology. However, many changes are needed before a systems biology level approach can be effectively incorporated into the regulatory toxicology framework. A workshop was held at the Annual Environmental Mutagen Society meeting in Vancouver, British Columbia, on advances in -omics applications. A number of recommendations emerged from the workshop discussion (beyond what activities are currently ongoing) aimed at advancing the ultimate goal of predictive systems toxicology from the present formative state of toxicogenomics. Recommendations include: (1) encouraging investigators to embrace open-access data sharing, (2) increasing current database and curation capacity, (3) establishment of large collaborative projects investigating multiple -omics endpoints within the same groups of animals, (4) mechanisms to encourage collaborative science including increasing the value of junior authorship on multi-authored papers and changes in the promotion process, (5) further development of standardized protocols, and (6) investment from the funding agencies and toxicology community to build the required infrastructure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,536

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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