Differential gene expression in infarct scar and viable myocardium from rat heart following coronary ligation
Notice bibliographique
Résumé
Post-myocardial infarction (MI) remodeling of cardiac myocytes and the myocardial interstitium results in alteration of gross ventricular geometry and ventricular dysfunction. To investigate the mechanisms of the remodeling process of the heart after large MI, the expression of various genes in viable left ventricle and infarct scar tissue were examined at 16 weeks post-MI. Steady-state expression of Na(+)-K+ ATPase alpha-1 and -2, phospholamban (PLB), alpha-myosin heavy chain (alpha-MHC), ryanodine receptor (Rya) and Ca2+ ATPase (Serca2) mRNAs were decreased in the infarct scar vs noninfarcted sham-operated controls (P < 0.05). On the other hand, Gialpha2 and beta-MHC mRNAs were upregulated (P < 0.05, respectively) in the infarct scar whereas Na(+)-K+ ATPase-beta, Na(+)-Ca2+ exchanger and Gs mRNAs were not altered vs control values. In viable left ventricle, the alpha-1 subunit of Na(+)-K+ ATPase, alpha-3, beta-isoforms, Rya, beta-MHC, Gialpha2, Gs and Na(+)-Ca2+ exchanger were significantly elevated while expression of the alpha-2 subunit of Na(+)-K+ ATPase, PLB and Serca2 were significantly decreased compared to controls. Expression of CK2alpha mRNA was elevated in noninfarcted heart (145 +/- 15%) and diminished in the infarct scar (66 +/- 13%) vs controls. Expression of beta-MHC mRNA was elevated in both viable and infarct scar tissues of experimental hearts (140 +/- 31% and 183 +/- 30% vs. controls, respectively). These results suggest that cardiac genes in the infarcted tissue and viable left ventricle following MI are differentially regulated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».