Molecular View of Cholesterol Flip-Flop and Chemical Potential in Different Membrane Environments
Notice bibliographique
Résumé
The relative stability of cholesterol in cellular membranes and the thermodynamics of fluctuations from equilibrium have important consequences for sterol trafficking and lateral domain formation. We used molecular dynamics computer simulations to investigate the partitioning of cholesterol in a systematic set of lipid bilayers. In addition to atomistic simulations, we undertook a large set of coarse grained simulations, which allowed longer time and length scales to be sampled. Our results agree with recent experiments (Steck, T. L.; et al. Biophys. J. 2002, 83, 2118-2125) that the rate of cholesterol flip-flop can be fast on physiological time scales, while extending our understanding of this process to a range of lipids. We predicted that the rate of flip-flop is strongly dependent on the composition of the bilayer. In polyunsaturated bilayers, cholesterol undergoes flip-flop on a submicrosecond time scale, while flip-flop occurs in the second range in saturated bilayers with high cholesterol content. We also calculated the free energy of cholesterol desorption, which can be equated to the excess chemical potential of cholesterol in the bilayer compared to water. The free energy of cholesterol desorption from a DPPC bilayer is 80 kJ/mol, compared to 67 kJ/mol for a DAPC bilayer. In general, cholesterol prefers more ordered and rigid bilayers and has the lowest affinity for bilayers with two polyunsaturated chains. Overall, the simulations provide a detailed molecular level thermodynamic description of cholesterol interactions with lipid bilayers, of fundamental importance to eukaryotic life.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».