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Enregistrement W2007627175 · doi:10.1128/jb.184.22.6316-6324.2002

Postgenomic Analysis of Four Novel Antigens of Group A <i>Streptococcus</i> : Growth Phase-Dependent Gene Transcription and Human Serologic Response

2002· article· en· W2007627175 sur OpenAlexaff
Sean D. Reid, Nicole M. Green, Gail L. Sylva, Jovanka M. Voyich, Elisha T. Stenseth, Frank R. DeLeo, Timothy Palzkill, Donald E. Low, Harry R. Hill, James M. Musser

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneSerotypeVirulenceStreptococcus equiStreptococcus pyogenesMicrobiologyImmune systemGeneticsBacteriaStaphylococcus aureus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Analysis of three group A Streptococcus genomes (serotypes M1, M3, and M18) recently identified four previously undescribed genes that encode extracellular proteins. Each of these genes encode proteins with an LPXTG amino acid motif that covalently links many virulence factors produced by gram-positive bacteria to the cell surface. Western immunoblot analysis of serum samples obtained from 80 patients with invasive infections, noninvasive soft tissue infections, pharyngitis, and rheumatic fever indicated that these four proteins are expressed in vivo. However, the level of gene transcript and the time of maximal gene transcription varied in representative serotype M1, M3, and M18 strains. Surface expression of two proteins was confirmed by flow cytometry. Studies using a mouse infection model suggest that antibodies specific for one of the proteins (Spy0843) may contribute to a protective host immune response against a serotype M1 infection. These results are additional evidence that postgenomic strategies provide new ways to identify and investigate novel bacterial proteins that may participate in host-pathogen interactions or serve as targets for therapeutics research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,722
Score d'incertitude au seuil0,461

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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