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Enregistrement W2007645750 · doi:10.1371/journal.pone.0005634

Control of Vertebrate Skeletal Mineralization by Polyphosphates

2009· article· en· W2007645750 sur OpenAlexafffund
Sidney Omelon, John Georgiou, Zachary J. Henneman, Lisa M. Wise, Balram Sukhu, Tanya Hunt, Chrystia Wynnyckyj, Douglas Holmyard, Ryszard Bielecki, Marc D. Grynpas

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMineralization (soil science)BiomineralizationApatiteCalciumChemistryMineralized tissuesPolyphosphatePhosphateAmorphous calcium phosphateBiophysicsBiochemistryMineralogyChemical engineeringBiologyMaterials scienceOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Skeletons are formed in a wide variety of shapes, sizes, and compositions of organic and mineral components. Many invertebrate skeletons are constructed from carbonate or silicate minerals, whereas vertebrate skeletons are instead composed of a calcium phosphate mineral known as apatite. No one yet knows why the dynamic vertebrate skeleton, which is continually rebuilt, repaired, and resorbed during growth and normal remodeling, is composed of apatite. Nor is the control of bone and calcifying cartilage mineralization well understood, though it is thought to be associated with phosphate-cleaving proteins. Researchers have assumed that skeletal mineralization is also associated with non-crystalline, calcium- and phosphate-containing electron-dense granules that have been detected in vertebrate skeletal tissue prepared under non-aqueous conditions. Again, however, the role of these granules remains poorly understood. Here, we review bone and growth plate mineralization before showing that polymers of phosphate ions (polyphosphates: (PO(3)(-))(n)) are co-located with mineralizing cartilage and resorbing bone. We propose that the electron-dense granules contain polyphosphates, and explain how these polyphosphates may play an important role in apatite biomineralization. PRINCIPAL FINDINGS/METHODOLOGY: The enzymatic formation (condensation) and destruction (hydrolytic degradation) of polyphosphates offers a simple mechanism for enzymatic control of phosphate accumulation and the relative saturation of apatite. Under circumstances in which apatite mineral formation is undesirable, such as within cartilage tissue or during bone resorption, the production of polyphosphates reduces the free orthophosphate (PO(4)(3-)) concentration while permitting the accumulation of a high total PO(4)(3-) concentration. Sequestering calcium into amorphous calcium polyphosphate complexes can reduce the concentration of free calcium. The resulting reduction of both free PO(4)(3-) and free calcium lowers the relative apatite saturation, preventing formation of apatite crystals. Identified in situ within resorbing bone and mineralizing cartilage by the fluorescent reporter DAPI (4',6-diamidino-2-phenylindole), polyphosphate formation prevents apatite crystal precipitation while accumulating high local concentrations of total calcium and phosphate. When mineralization is required, tissue non-specific alkaline phosphatase, an enzyme associated with skeletal and cartilage mineralization, cleaves orthophosphates from polyphosphates. The hydrolytic degradation of polyphosphates in the calcium-polyphosphate complex increases orthophosphate and calcium concentrations and thereby favors apatite mineral formation. The correlation of alkaline phosphatase with this process may be explained by the destruction of polyphosphates in calcifying cartilage and areas of bone formation. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: We hypothesize that polyphosphate formation and hydrolytic degradation constitute a simple mechanism for phosphate accumulation and enzymatic control of biological apatite saturation. This enzymatic control of calcified tissue mineralization may have permitted the development of a phosphate-based, mineralized endoskeleton that can be continually remodeled.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,566

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations210
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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