Identification and Functional Characterization of a Conserved, Nuclear Factor 1-like Element in the Proximal Promoter Region ofCYP1A2 Gene Specifically Expressed in the Liver and Olfactory Mucosa
Notice bibliographique
Résumé
CYP1A2 is a major cytochrome P-450 isoform in the liver and the olfactory mucosa but is essentially not expressed in other tissues. A nuclear factor 1 (NF-1) -like element was identified in the proximal promoter region of rat, mouse, rabbit, and human CYP1A2 genes through data base analysis. In vitro DNase I footprinting with a -211 to +81 probe from the rat CYP1A2 gene and nuclear extracts from rat liver and olfactory mucosa revealed a single protected region corresponding to the NF-1-like element at -129 to -111. Protein binding to this NF-1-like element was tissue-selective and was confirmed by in vivo footprinting in native chromatin from rat liver. Multiple DNA-binding complexes were detected in gel-shift assays using the CYP1A2 NF-1-like element and nuclear extracts from liver and olfactory mucosa, all of which were supershifted in the presence of an anti-NF1 antibody. The NF-1-like element was essential for transcriptional activity of the CYP1A2 gene in an in vitro transcription assay using nuclear extracts from the two tissues. Thus, members of the NF-1 family of transcription factors may play an important role in the tissue-selective expression of the CYP1A2 gene in the liver and olfactory mucosa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».