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Enregistrement W2007691077 · doi:10.5339/qfarf.2013.biop-035

A Semantic Web Framework To Computerize And Execute Clinical Guidelines: Towards The Handling Of Co-Morbidities In Clinical Decision Support Systems

2013· article· en· W2007691077 sur OpenAlexaffabout
Syed Sibte Raza Abidi

Notice bibliographique

RevueQatar Foundation Annual Research Forum Volume 2013 Issue 1 · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClinical decision support systemInteroperabilityOntologyDecision support systemComputer scienceSemantic interoperabilityMedicinePsychological interventionAtrial fibrillationKnowledge managementMedical emergencyIntensive care medicineData miningNursingWorld Wide WebInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: A Canadian study recommends General Practitioners (GP) to use evidence based Clinical Guidelines (CG) when dealing with co-morbid cardiovascular diseases, in particular for the diagnosis and preliminary management of co-morbid Chronic Heart Failure (CHF) and Atrial Fibrillation (AF). Although paper-based Canadian CG exist for the management of CHF and AF, the challenge for physicians is to simultaneously apply multiple independent CG when dealing with patients having cardiovascular co-morbidities. Objective: The objective of this inter-disciplinary research program is to assist physicians in handling co-morbidities through a computerized clinical decision support framework that recommends evidence-based interventions based on the patient's health profile. We target decision support for the diagnosis and treatment of CHF, AF and co-morbid CHF-AF. Approach: We take a healthcare knowledge management approach to develop a Clinical Decision Support System (CDSS) for handling comorbid diseases. Our solution involves the development of institution-specific CP from a combination of CG, and then generate a CP knowledge model using a semantically-rich formalism—i.e. a CG ontology. The CG ontology semantically defines the clinical concepts in order to establish semantic interoperability between multiple CG. Next, we systematically align the ontologically-modeled CG of different diseases to realize a unified knowledge model that derives the evidence based recommendations for handling both single and co-morbid diseases. Our methodology entails the following steps: (i) knowledge identification to derive specialized disease-specific CG from existing evidence-based sources; (b) knowledge modeling to abstract medical and procedural knowledge from the CG; (c) knowledge representation to computerize the CG in terms of a semantically-rich CG ontology; (d) knowledge alignment to systematically synthesize multiple ontologically-modeled CG to develop a unified ontology-based CG knowledge model representing comorbid diseases; (e) knowledge execution to generate patient-specific recommendations, based on patient data, by reasoning over the aligned CG model; and (f) evaluation of the knowledge model and the recommendations produced in response to a range of clinical scenarios. Results: We present the COMET (Co-morbidity Ontological Modeling & ExecuTion) system to provide clinical decision support for three scenarios: (i) Cardiac Heart Failure (CHF); (ii) Atrial Fibrillation (AF); and (iii) co-morbidity of either AF or CHF. COMET is designed for GP in Nova Scotia and is accessible over the web. Evaluation: A pilot study was conducted to assess how well COMET meets the physician's needs to manage co-morbid CHF-AF. Conclusion: In conclusion, this project provides a solution for the complex problem of handling co-morbidities in a CDSS. Our solution is based on semantic modeling of disease-specific knowledge which extends the possibility of scaling up to include additional diseases and aligning their knowledge models to handle even further co-morbid situations. Our CG alignment approach helps (a) avoiding duplication of clinical tasks; (b) re-usability of diagnostic results; (c) determine compatibility of different clinical activities; and (d) standardization of care across multiple institutions. We believe that this project achieves knowledge translation whereby we have successfully computerized and translated paper-based CG so that they can now be operationalized at the point-of-care by GP to handle comorbid diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,314
Score d'incertitude au seuil0,862

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,481
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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