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Enregistrement W2007709025 · doi:10.1139/y01-033

Allosteric regulatory step and configuration of the ATP-binding pocket in atrial natriuretic factor receptor guanylate cyclase transduction mechanism

2001· article· en· W2007709025 sur OpenAlexvenueno aff
Rameshwar K. Sharma, Prem N. Yadav, Teresa Duda

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Public Health Service
Mots-clésAllosteric regulationNPR1Signal transductionNPR2BiochemistryHAMP domainCell biologyReceptorCyclaseBiologyChemistryBinding siteBinding domainInternal medicineNatriuretic peptideMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The atrial natriuretic factor (ANF) signal transduction mechanism consists of the transformation of the signal information into the production of cyclic GMP. The binding of ANF to its receptor, which is also a guanylate cyclase, generates the signal. This cyclase has been termed atrial natriuretic factor receptor guanylate cyclase, ANF-RGC. ANF-RGC is a single transmembrane-spanning protein. The ANF receptor domain resides in the extracellular region of the protein, and the catalytic domain is located in the intracellular region at the C-terminus of the protein. Thus, the signal is relayed progressively from the receptor domain to the catalytic domain, where it is converted into the formation of cyclic GMP. The first transduction step is the direct binding of ATP with ANF-RGC. This causes allosteric regulation of the enzyme and primes it for the activation of its catalytic moiety. The partial structural motif of the ATP binding domain in ANF-RGC has been elucidated, and it has been named ATP regulatory module (ARM). In this presentation, we provide a brief review of the ATP-regulated transduction mechanism and the ARM model. The model depicts a configuration of the ATP-binding pocket that has been experimentally validated, and the model shows that the ATP-dependent transduction process is a two- (or more) step event. The first step involves the binding of ATP with its ARM. This partially activates the cyclase and prepares it for the subsequent steps, which are consistent with its being phosphorylated and attaining the fully activated state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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