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Enregistrement W2007927189 · doi:10.1111/j.1750-3639.2004.tb00067.x

Gene Expression Profiling Reveals Unique Molecular Subtypes of Neurofibromatosis Type I‐associated and Sporadic Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumors

2004· article· en· W2007927189 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBrain Pathology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesStanford Bio-X
Mots-clésNeurofibromatosisGene expression profilingGene signatureBiologyGene expressionCancer researchDNA microarrayPathologyGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs) are highly aggressive Schwann cell neoplasms that are frequently associated with Type I Neurofibromatosis (NF1) and respond poorly to current therapeutic regimens. To better understand the molecular heterogeneity of these tumors, we performed gene expression profiling on 25 NF1-associated and 17 sporadic MPNSTs using oligonucleotide microarrays representing approximately 8100 unique human gene transcripts. Using several previously reported statistical approaches, we were unable to identify a molecular signature that could reliably distinguish between NF1-associated and sporadic MPNSTs in independent training and test sample sets. However, using an unsupervised clustering approach, we identified an extensive gene expression signature that distinguished 9 of the 42 tumors analyzed. This signature corresponded to relative overexpression of transcripts associated with neuroglial differentiation (NCAM, MBP, L1CAM, P1P) and relative down-regulation of proliferation and growth factor associated transcripts (IGF2, FGFR1, MDK, Ki67). All tumors with this gene expression signature lacked expression of EGFR and all but one tumor were derived from patients with NF1. However, there were no other obvious associations with histological grade, tumor site, metastasis, recurrence, age, or patient survival. We conclude that distinct molecular classes of MPNST exist and that the ability to stratify these tumors based on unique and biologically relevant gene expression profiles may be important for future targeted therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,850

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle