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Enregistrement W2007945445 · doi:10.1074/jbc.m511714200

Cj1121c, a Novel UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C-4 Aminotransferase Essential for Protein Glycosylation and Virulence in Campylobacter jejuni

2006· article· en· W2007945445 sur OpenAlexaff
Somalinga Vijayakumar, Alexandra Merkx-Jacques, Dinath B. Ratnayake, Irene Gryski, Ravinder Kaur Obhi, Sébastien Houle, Charles M. Dozois, Carole Creuzenet

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniVirulenceGlycosylationMicrobiologyBiologyBiochemistryChemistryBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter jejuni produces glycoproteins that are essential for virulence. These glycoproteins carry diacetamidobacillosamine (DAB), a sugar that is not found in humans. Hence, the enzymes responsible for DAB synthesis represent potential therapeutic targets. We describe the biochemical characterization of Cj1121c, a putative aminotransferase encoded by the general protein glycosylation locus, to assess its role in DAB biosynthesis. By using overexpressed and affinity-purified enzyme, we demonstrate that Cj1121c has pyridoxal phosphate- and glutamate-dependent UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C-4 transaminase activity and produces UDP-4-amino-4,6-dideoxy-GlcNAc. This is consistent with a role in DAB biosynthesis and distinguishes Cj1121c from Cj1294, a homologous UDP-2-acetamido-2,6-dideoxy-beta-l-arabino-4-hexulose C-4 aminotransferase that we characterized previously. We show that Cj1121c can also use this 4-keto-arabino sugar indirectly as a substrate, that Cj1121c and Cj1294 are active simultaneously in C. jejuni, and that the activity of Cj1121c is preponderant under standard growth conditions. Kinetic data indicate that Cj1121c has a slightly higher catalytic efficiency than Cj1294 with regard to the 4-keto-arabino substrate. By site-directed mutagenesis, we show that residues Glu-158 and Leu-131 are not essential for catalysis or for substrate specificity contrary to expectations. We further demonstrate that a cj1121c knock-out mutant is impaired for flagella-mediated motility, for invasion of intestinal epithelial cells, and for persistence in the chicken intestine, clearly demonstrating that Cj1121c is essential for host colonization and virulence. Finally, we show that cj1121c is necessary for protein glycosylation by lectin Western blotting. Collectively, these results validate Cj1121c as a promising drug target and provide the means to assay for inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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