MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2008001323 · doi:10.1038/nature08140

The Schistosoma japonicum genome reveals features of host–parasite interplay

2009· article· en· W2008001323 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueNature · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasites and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational High-tech Research and Development ProgramMedical Research CouncilChinese Academy of SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Health and Medical Research CouncilNational Natural Science Foundation of ChinaWellcome Trust
Mots-clésSchistosoma japonicumParasite hostingHost (biology)GenomeBiologyComputational biologyEvolutionary biologyGeneticsGeneHelminthsZoologySchistosomiasisComputer scienceWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schistosoma japonicum is a parasitic flatworm that causes human schistosomiasis, which is a significant cause of morbidity in China and the Philippines. Here we present a draft genomic sequence for the worm. The genome provides a global insight into the molecular architecture and host interaction of this complex metazoan pathogen, revealing that it can exploit host nutrients, neuroendocrine hormones and signalling pathways for growth, development and maturation. Having a complex nervous system and a well-developed sensory system, S. japonicum can accept stimulation of the corresponding ligands as a physiological response to different environments, such as fresh water or the tissues of its intermediate and mammalian hosts. Numerous proteases, including cercarial elastase, are implicated in mammalian skin penetration and haemoglobin degradation. The genomic information will serve as a valuable platform to facilitate development of new interventions for schistosomiasis control. Two international consortia this week report the whole genome sequences of the blood flukes Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum, two of the three major pathogens that cause schistosomiasis, also called bilharzia. Schistosomiasis is a 'neglected' tropical disease affecting more than 200 million people in 76 countries. Analyses of the new genome sequences provide insights into the molecular architecture and host interactions of these pathogens, as well as avenues for future development of targeted interventions for this disease. These are the first two flatworm genomes to be sequenced, so they offer new angles on the early events in animal evolution, in particular the determination of body pattern and the development of tissues into organs. Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum are the pathogenic agents that cause the tropical disease schistosomiasis. Here, and in an accompanying paper, the genomes of these two flatworms are sequenced and analysed. The results provide insights into the molecular architecture and host interactions of the flatworms, as well as avenues for future development of targeted interventions for schistosomiasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations678
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNatureMême sujetParasites and Host InteractionsTravaux en français237 207