A Sleeping Beauty transposon-mediated screen identifies murine susceptibility genes for adenomatous polyposis coli ( <i>Apc</i> )-dependent intestinal tumorigenesis
Notice bibliographique
Résumé
It is proposed that a progressive series of mutations and epigenetic events leads to human colorectal cancer (CRC) and metastasis. Furthermore, data from resequencing of the coding regions of human CRC suggests that a relatively large number of mutations occur in individual human CRC, most at low frequency. The functional role of these low-frequency mutations in CRC, and specifically how they may cooperate with high-frequency mutations, is not well understood. One of the most common rate-limiting mutations in human CRC occurs in the adenomatous polyposis coli (APC) gene. To identify mutations that cooperate with mutant APC, we performed a forward genetic screen in mice carrying a mutant allele of Apc (Apc(Min)) using Sleeping Beauty (SB) transposon-mediated mutagenesis. Apc(Min) SB-mutagenized mice developed three times as many polyps as mice with the Apc(Min) allele alone. Analysis of transposon common insertion sites (CIS) identified the Apc locus as a major target of SB-induced mutagenesis, suggesting that SB insertions provide an efficient route to biallelic Apc inactivation. We also identified an additional 32 CIS genes/loci that may represent modifiers of the Apc(Min) phenotype. Five CIS genes tested for their role in proliferation caused a significant change in cell viability when message levels were reduced in human CRC cells. These findings demonstrate the utility of using transposon mutagenesis to identify low-frequency and cooperating cancer genes; this approach will aid in the development of combinatorial therapies targeting this deadly disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».