Variation of paternal contribution in a seed orchard of <i>Cryptomeria japonica</i> determined using microsatellite markers
Notice bibliographique
Résumé
We investigated gene flow and pollen contamination in a seed orchard of Cryptomeria japonica D. Don using six microsatellite markers. The quality of a seed crop is determined by many factors, including the rate of pollen contamination from outside sources, degree of self-fertilization, and equality of the clones as pollen donors. The surveyed seed orchard consisted of 62 clones and a total of 360 ramets. The seeds from 12 mother trees in the seed orchard were investigated using six highly polymorphic loci with high multipaternity exclusion probability (0.999). The estimated average pollen contamination rate was high at 47.78% (±4.12%), and the clonal self-fertilization rate was 2.22% (±0.94%) when we assumed that null alleles were present. The high pollen contamination rate could dramatically reduce the quality of the seed crop. The contamination rate differed from tree to tree, but the differences were not related to the location of each individual. The levels of contribution as pollen donors differed significantly amongst clones in the seed orchard. Differences in flowering phenology and relative pollen fecundity may be responsible for the differences in paternal contributions. The effective distance of pollen dispersal in this C. japonica seed orchard seemed to be greater than previously estimated.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».