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Enregistrement W2008266870 · doi:10.1002/cne.20939

Neuron‐specific expression of a synaptotagmin gene in the sea urchin <i>Strongylocentrotus purpuratus</i>

2006· article· en· W2008266870 sur OpenAlexafffund
Robert D. Burke, Lisa C. Osborne, Diana Wang, Naoyuki Murabe, Shunsuke Yaguchi, Yoko Nakajima

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Comparative Neurology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEchinoderm biology and ecology
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesKeio UniversityGenome British ColumbiaUniversity of Victoria
Mots-clésBiologyStrongylocentrotus purpuratusSynaptotagmin 1ChordateComplementary DNACell biologycDNA libraryColocalizationMolecular biologyGeneGeneticsSea urchinVertebrate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interest in chordate evolution has emphasized a need for a better understanding of the comparative neuroanatomy of invertebrate deuterostomes. However, molecular and genetic approaches to neurobiological studies in these groups are hampered by a lack of neuron-specific molecular markers. A monoclonal antibody, 1E11, is neuron specific and is useful in identification of neural structures in larvae and adults of echinoderms, hemichordates, and urochordates. To identify a neuron-specific gene product, we have characterized the antigen recognized by 1E11. In immunoblots and immunoprecipitations of neural tissue from adult Strongylocentrotus purpuratus, 1E11 recognizes a 57-kDa band. Tandem mass spectrometry of trypsin digests of the 57-kDa band permitted peptide mass mapping and sequencing of five peptides. All of the sequenced peptides, and 12 additional mass-mapped peptides, are found within the open reading frame of a cDNA encoding synaptotagmin B (Sp-SynB). In situ RNA hybridizations with synaptotagmin B probes with S. purpuratus larvae reveal a pattern of expression that is similar to that revealed by the antibody 1E11. Antibodies produced against a bacterially expressed Sp-SynB protein recognize a 57-kDa protein and colocalize with 1E11. When a full-length Sp-SynB cDNA is expressed in chicken embryonic cells, the cells become immunoreactive to 1E11. We conclude that synaptotagmin B is a gene expressed in neurons that has conserved epitopes in other invertebrate deuterostomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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