Gene expression profiling in human skeletal muscle during recovery from eccentric exercise
Notice bibliographique
Résumé
We used cDNA microarrays to screen for differentially expressed genes during recovery from exercise-induced muscle damage in humans. Male subjects (n = 4) performed 300 maximal eccentric contractions, and skeletal muscle biopsy samples were analyzed at 3 h and 48 h after exercise. In total, 113 genes increased 3 h postexercise, and 34 decreased. At 48 h postexercise, 59 genes increased and 29 decreased. On the basis of these data, we chose 19 gene changes and conducted secondary analyses using real-time RT-PCR from muscle biopsy samples taken from 11 additional subjects who performed an identical bout of exercise. Real-time RT-PCR analyses confirmed that exercise-induced muscle damage led to a rapid (3 h) increase in sterol response element binding protein 2 (SREBP-2), followed by a delayed (48 h) increase in the SREBP-2 gene targets Acyl CoA:cholesterol acyltransferase (ACAT)-2 and insulin-induced gene 1 (insig-1). The expression of the IL-1 receptor, a known regulator of SREBP-2, was also elevated after exercise. Taken together, these expression changes suggest a transcriptional program for increasing cholesterol and lipid synthesis and/or modification. Additionally, damaging exercise induced the expression of protein kinase H11, capping protein Z alpha (capZalpha), and modulatory calcineurin-interacting protein 1 (MCIP1), as well as cardiac ankryin repeat protein 1 (CARP1), DNAJB2, c-myc, and junD, each of which are likely involved in skeletal muscle growth, remodeling, and stress management. In summary, using DNA microarrays and RT-PCR, we have identified novel genes that respond to skeletal muscle damage, which, given the known biological functions, are likely involved in recovery from and/or adaptation to damaging exercise.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».