Dismantling Melaspileaceae: a first phylogenetic study of Buelliella, Hemigrapha, Karschia, Labrocarpon and Melaspilea
Notice bibliographique
Résumé
Melaspileaceae is a heterogeneous group of Ascomycota including lichenized, lichenicolous and saprobic fungi. A first phylogenetic study of Melaspileaceae is presented and is based on mtSSU and nuLSU sequence data. We obtained 49 new sequences for 28 specimens representing 15 species. The genera Buelliella, Hemigrapha, Karschia, Labrocarpon and Melaspilea s. str. are included in a molecular phylogeny for the first time. Melaspileaceae is recovered as polyphyletic, with members placed in two main lineages of Dothideomycetes. Melaspilea s. str. is included in Eremithallales. Eremithallaceae is placed in synonymy with Melaspileaceae. The genus Encephalographa is placed in Melaspileaceae. The genera Buelliella, Karschia, Labrocarpon and several members of Melaspilea are demonstrated to belong to Asterinales, while Hemigrapha is confirmed in this order. The genera Melaspileella, Melaspileopsis, Stictographa are reinstated for former Melaspilea species now placed in Asterinales. Karschia cezannei is described as new, and the new combinations Melaspilea costaricensis, M. enteroleuca, M. urceolata, Melaspileella proximella and Melaspileopsis diplasiospora are made. Melaspileaceae as newly defined includes lichenized and saprobic species. The lichenicolous and saprobic life styles form different intermixed lineages in Asterinales that do not include lichenized taxa. The phylogenetic data provide a first framework for dismantling further the genus Melaspilea for which most of the species are expected to belong to Asterinales.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».