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Enregistrement W2008392950 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-04-0223

Sp1-Mediated Transcriptional Control of Fibroblast Growth Factor Receptor 4 in Sarcomas of Skeletal Muscle Lineage

2004· article· en· W2008392950 sur OpenAlexaff
Shun Yu, Lei Zheng, Marc Ladanyi, L. Sylvia, Shereen Ezzat

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkMount Sinai HospitalUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFibroblast growth factor receptor 4Molecular biologyBiologyCell cultureTranscription factorTransfectionFibroblast growth factorAlveolar rhabdomyosarcomaGeneCancer researchReceptorFibroblast growth factor receptorRhabdomyosarcomaGeneticsMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fibroblast growth factor receptors (FGFRs) have been implicated in a multitude of differentiating and proliferative actions. FGFR4 is expressed mainly in lung, kidney, pancreas, spleen, and developing muscle. FGFR4 was found to be overexpressed in some human malignancies, where it has been implicated in their pathogenesis. Recently, FGFR4 was found to be overexpressed in pediatric rhabdomyosarcomas, based on cDNA microarray analysis. Using Northern blotting, reverse transcription-polymerase chain reaction, and Western blotting, we classified four human rhabdomyosarcoma-derived cell lines based on their relative expression of FGFR4. We defined a 214 bp (-115/+99) promoter that functioned as a minimal promoter and examined cis-DNA elements implicated in the control of expression of the FGFR4 gene in these cells. Overlapping 40- to 50-bp fragments of the minimal promoter were examined by electrophoretic mobility shift assay using nuclear extracts from cell lines with high (HS729-1015) or low (HS729-1016) FGFR4 expression. Fragment C (-65/-26) formed specific complexes with nuclear extracts from both cell lines. Fragment B (-95/-56), however, formed distinct complexes mainly with the high FGFR4-expressing HS729-1015 cells. Both fragments yielded complexes that were competed by an Sp oligonucleotide and supershifted by Sp1 and by Sp3 antibodies. Transfection of Sp1 but not Sp3 efficiently activated FGFR4 promoter activity, an effect that was significantly more pronounced in the HS729-1015 cell line than in the low FGFR4-expressing HS729-1016 cell line. Deletion of each of the two Sp-binding sites in fragments B and C resulted in loss of promoter activity. In particular, deletion of the 5' Sp-binding site in fragment B was associated with the greatest loss of activity. Sp1 protein expression correlated with FGFR4 expression in cell lines and primary human rhabdomyosarcomas. Furthermore, transfection of Sp1 and methylation inhibition was effective in inducing the endogenous FGFR4 gene in HS729-1015 cells. Our findings point to Sp1 as an important contributor to FGFR4 transcriptional control and elucidate a potential mechanism for the heterogeneous expression of FGFR4 in neoplasms derived from the same cell lineage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,496
Score d'incertitude au seuil0,711

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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