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Enregistrement W2008413774 · doi:10.1158/1078-0432.mechres-ia11

Abstract IA11: Using Molecular Profiling Strategies in Clinical Trials to Understand Resistance Mechanisms in the Era of Personalized Cancer Medicine

2012· article· en· W2008413774 sur OpenAlexaff
Lillian L. Siu

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVemurafenibMedicineAcquired resistanceDruggabilityDrug resistanceClinical trialMelanomaOncologyPrecision medicineCancerCancer researchIpilimumabInternal medicineBioinformaticsBiologyMetastatic melanomaPathologyImmunotherapyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Resistance to molecularly targeted agents remains a key challenge in cancer therapeutics. Even in the setting of oncogenically addicted tumor types matched with potent and specific kinase inhibitors, the duration of drug response is limited. For example, in the phase III trial of vemurafenib versus dacarbazine in patients with advanced malignant melanoma harboring BRAF V600E mutations, 48% of patients in the vermurafenib arm achieved an objective response with a progression-free survival of 5.3 months (Chapman et al. N Engl J Med 2011). A caveat to this clearly positive clinical trial is that there are patients whose tumors have the same mutations who did not respond to vemurafenib and amongst those who did, the duration of response remains limited. In tumors that harbor driver mutations or other genetic aberrations, mechanisms of resistance are of relevance, including both primary resistance that renders them insensitive to specific inhibitors, and evolved/acquired resistance that results in tumor growth despite initial sensitivity. Comprehensive molecular profiling of pre-treatment tumor samples and at progression would be informative to offer insight into such mechanisms of primary and evolved/acquired resistance and guide clinical trial designs to counteract them. Combinatorial strategies may be considered upfront for patients who have tumor characteristics suggestive of primary resistance. For patients with sensitive disease which evolve/acquire resistance during treatment, a repeat tumor biopsy may help detect newly emerged aberrations that are potentially druggable. Additional areas of interest in defining tumor resistance include the observations that same mutation may have different degrees of functionality in different tumor types (e.g. BRAF mutations in melanoma versus colorectal cancer) and different mutations of the same gene may confer different drug sensitivities (e.g. activating and inactivating BRAF mutations), These context-dependent phenomena further complicate the planning of histology-agnostic, mutation-specific clinical trials using targeted agents. Efforts to provide detailed tumor molecular profiling information in clinical trials are relevant to help distinguish signatures of sensitivity versus resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,030
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,161

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0300,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,507
Tête enseignante GPT0,594
Écart entre enseignants0,087 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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