Surface modifications of influenza proteins upon virus inactivation by β‐propiolactone
Notice bibliographique
Résumé
Inactivation of intact influenza viruses using formaldehyde or β-propiolactone (BPL) is essential for vaccine production and safety. The extent of chemical modifications of such reagents on viral proteins needs to be extensively investigated to better control the reactions and quality of vaccines. We have evaluated the effect of BPL inactivation on two candidate re-assortant vaccines (NIBRG-121xp and NYMC-X181A) derived from A/California/07/2009 pandemic influenza viruses using high-resolution FT-ICR MS-based proteomic approaches. We report here an ultra performance LC MS/MS method for determining full-length protein sequences of hemagglutinin and neuraminidase through protein delipidation, various enzymatic digestions, and subsequent mass spectrometric analyses of the proteolytic peptides. We also demonstrate the ability to reliably identify hundreds of unique sites modified by propiolactone on the surface of glycoprotein antigens. The location of these modifications correlated with changes to protein folding, conformation, and stability, but demonstrated no effect on protein disulfide linkages. In some cases, these modifications resulted in suppression of protein function, an effect that correlated with the degree of change of the modified amino acids' side chain length and polarity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».