Regulation of the α-fetoprotein gene by the isoforms of ATBF1 transcription factor in human hepatoma
Notice bibliographique
Résumé
We investigated mechanisms regulating expression of alpha-fetoprotein (AFP) in 3 human hepatoma cell lines, HuH-7, HepG2, and huH-1, producing high, medium, and low levels of AFP, respectively. The silencer, a negative cis-acting element of the AFP gene, was highly activated in huH-1 and HepG2 to repress AFP enhancer activity by 91%, whereas only 26% repression was observed in HuH-7. To account for the difference in AFP production between HepG2 and huH-1, we investigated the roles of two isoforms of the AT motif-binding factor 1 (ATBF1) transcription factor, ATBF1-A and -B. Cotransfection assays showed that the ATBF1 isoforms regulated the AFP gene differently in HepG2 and huH-1. In huH-1 and HuH-7, both ATBF1 isoforms suppressed strongly enhancer activity and slightly promoter activity. In HepG2, on the other hand, ATBF1-A suppressed the enhancer and promoter activities, but surprisingly, ATBF1-B was found to stimulate enhancer activity while showing no effect on the promoter. Levels of ATBF1-A mRNA were similar in all 3 cell lines, whereas the expression ATBF1-B mRNA varied greatly, with the highest level seen in HepG2 followed by huH-1 and HuH-7. These results suggest that, in HepG2, ATBF1-B may have a dominant negative effect to relieve the transcriptional repression caused by its isoform. In support of this view, we found that the N-terminal region specific to the ATBF1-A molecule possessed transcriptional repressor activity. Thus, the use of the ATBF1 variants as well as the silencer may provide a unique mechanism that contributes to the determination of AFP levels in human hepatoma cell lines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».