The effect of heavy atoms on the conformation of the active-site polypeptide loop in human ABO(H) blood-group glycosyltransferase B
Notice bibliographique
Résumé
The human ABO(H) blood-group antigens are oligosaccharide structures that are expressed on erythrocyte and other cell surfaces. The terminal carbohydrate residue differs between the blood types and determines the immune reactivity of this antigen. Individuals with blood type A have a terminal N-acetylgalactosamine residue and those with blood type B have a terminal galactose residue. The attachment of these terminal carbohydrates are catalyzed by two different glycosyltransferases: an alpha(1-->3)N-acetylgalactosaminyltransferase (GTA) and an alpha(1-->3)galactosyltransferase (GTB) for blood types A and B, respectively. GTA and GTB are homologous enzymes that differ in only four of 354 amino-acid residues (Arg/Gly176, Gly/Ser235, Leu/Met266 and Gly/Ala268 in GTA and GTB, respectively). Diffraction-quality crystals of GTA and GTB have previously been grown from as little as 10 mg ml(-1) stock solutions in the presence of Hg, while diffraction-quality crystals of the native enzymes require much higher concentrations of protein. The structure of a single mutant C209A has been determined in the presence and absence of heavy atoms and reveals that when mercury is complexed with Cys209 it forces a significant level of disorder in a polypeptide loop (amino acids 179-195) that is known to cover the active site of the enzyme. The observation that the more highly disordered structure is more amenable to crystallization is surprising and the derivative provides insight into the mobility of this polypeptide loop compared with homologous enzymes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».