MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2008562316 · doi:10.1186/1746-6148-9-137

Fecal shedding of Brachyspira spp. on a farrow-to-finish swine farm with a clinical history of “Brachyspira hampsonii”-associated colitis

2013· article· en· W2008562316 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueBMC Veterinary Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary medicine and infectious diseases
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Swine Health Board
Mots-clésFecesPistacia lentiscusColitisBiologyVeterinary medicineMicrobiologyMedicineImmunologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Brachyspira associated diarrhea is a re-emerging concern for Canadian swine producers. To identify critical control points for reducing the impact of Brachyspira on production, improved diagnostic tools and a better understanding of the on-farm epidemiology of these pathogens are required. A cross-sectional study was conducted for the detection of Brachyspira on a commercial, two-site, farrow-to-finish pork production unit in Saskatchewan, Canada with a clinical history of mucohaemorrhagic colitis associated with "B. hampsonii". RESULTS: Rectal swabs from pigs at all production stages were collected over 13 weeks (n=866). Two swabs were collected per pig for culture and Gram stain, and for PCR. Ninety-one culture positive samples were detected, with the highest prevalence of Brachyspira shedding in grower pigs (21%). No Brachyspira were detected in pre-weaned piglets. PCR and Gram stain of rectal swabs detected fewer positive samples than culture. The most prevalent species detected was B. murdochii; other species detected included B. pilosicoli, B. innocens, and "Brachyspira hampsonii". Phylogenetic analysis revealed that several of the isolates, including some strongly beta-haemolytic isolates, might represent novel taxa. CONCLUSIONS: Our results indicate that apparently healthy pigs can be colonized with diverse Brachyspira species, including some potential pathogens, and that frequency of shedding peaks in the grower stage. Difference in the detection rates of Brachyspira amongst culture, Gram stain or PCR on rectal swabs have implications for choice of detection methods and surveillance approaches that may be most effective in Brachyspira control strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,310
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,340
Tête enseignante GPT0,453
Écart entre enseignants0,113 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle