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Enregistrement W2008575230 · doi:10.1128/jb.184.3.679-686.2002

Effects of Deletion of Genes Encoding Fe-Only Hydrogenase of <i>Desulfovibrio vulgaris</i> Hildenborough on Hydrogen and Lactate Metabolism

2002· article· en· W2008575230 sur OpenAlex
Brant Pohorelic, Johanna K. Voordouw, Élisabeth Lojou, Alain Dolla, Jens Harder, Gerrit Voordouw

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueU.S. Department of Energy
Mots-clésDesulfovibrio vulgarisHydrogenasePeriplasmic spaceDesulfovibrioMutantBiochemistryBiologySulfateChemistryEnzymeBacteriaGeneEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The physiological properties of a hyd mutant of Desulfovibrio vulgaris Hildenborough, lacking periplasmic Fe-only hydrogenase, have been compared with those of the wild-type strain. Fe-only hydrogenase is the main hydrogenase of D. vulgaris Hildenborough, which also has periplasmic NiFe- and NiFeSe-hydrogenases. The hyd mutant grew less well than the wild-type strain in media with sulfate as the electron acceptor and H(2) as the sole electron donor, especially at a high sulfate concentration. Although the hyd mutation had little effect on growth with lactate as the electron donor for sulfate reduction when H(2) was also present, growth in lactate- and sulfate-containing media lacking H(2) was less efficient. The hyd mutant produced, transiently, significant amounts of H(2) under these conditions, which were eventually all used for sulfate reduction. The results do not confirm the essential role proposed elsewhere for Fe-only hydrogenase as a hydrogen-producing enzyme in lactate metabolism (W. A. M. van den Berg, W. M. A. M. van Dongen, and C. Veeger, J. Bacteriol. 173:3688-3694, 1991). This role is more likely played by a membrane-bound, cytoplasmic Ech-hydrogenase homolog, which is indicated by the D. vulgaris genome sequence. The physiological role of periplasmic Fe-only hydrogenase is hydrogen uptake, both when hydrogen is and when lactate is the electron donor for sulfate reduction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle