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Enregistrement W2008600022 · doi:10.1371/journal.pone.0098358

CD47-Independent Effects Mediated by the TSP-Derived 4N1K Peptide

2014· article· en· W2008600022 sur OpenAlexafffund
Pascal Leclair, Chinten James Lim

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensBC Children's HospitalChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChild and Family Research Institute
Mots-clésCD47Thrombospondin 1IntegrinFibronectinCell biologyEpitopePeptideReceptorCell adhesionAntibodyCell cultureThrombospondinChemistryCellBiologyMolecular biologyBiochemistryImmunologyCancer researchMetalloproteinaseEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

4N1K is a peptide fragment derived from the C-terminal, globular domain of thrombospondin which has been shown to mediate integrin-dependent cell adhesion and promote integrin activation acting via the cell-surface receptor, CD47. However, some studies found that 4N1K could act independently of CD47, putting in question the specificity of 4N1K for CD47. This led us to characterize the cellular and non-cellular effects of 4N1K. We found that 4N1K stimulated a potent increase in binding of a variety of non-specific IgG antibodies to cells in suspension. We also found that these same antibodies, as well as CD47-deficient cells, could bind substrate-immobilized 4N1K significantly better than a control peptide, 4NGG. Furthermore, we found that cells treated with 4N1K at higher concentrations inhibited, while lower concentrations promoted cell adhesion to immobilized fibronectin as an integrin substrate. Importantly, both the stimulatory and the inhibitory activity of 4N1K occurred as efficiently in the CD47-deficient JinB8 cells, as it did in the CD47-expressing parental or in JinB8 cells reconstituted with CD47 expression. Given these results, we suggest that 4N1K interacts non-specifically with epitopes commonly found on the cell surface, and conclude that it is not a suitable peptide for use to study the consequences of CD47 receptor ligation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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