Construction and In Vitro Properties of a Series of Attenuated Simian Immunodeficiency Viruses with All Accessory Genes Deleted
Notice bibliographique
Résumé
We have generated simplified simian immunodeficiency virus (SIV) constructs lacking the nef, vpr, vpx, vif, tat, and rev genes (Delta6 viruses). To accomplish this, we began with an infectious molecular clone of SIV, i.e. SIVmac239, and replaced the deleted segments with three alternate elements: (i) a constitutive transport element (CTE) derived from simian retrovirus type 1 to replace the Rev/Rev-responsive element (RRE) posttranscriptional regulation system, (ii) a chimeric SIV long terminal repeat (LTR) containing a cytomegalovirus (CMV) promoter to augment transcription and virus production, and (iii) an internal ribosome entry site (IRES) upstream of the env gene to ensure expression of envelope proteins. This simplified construct (Delta6CCI) efficiently produced all viral structural proteins, and mature virions possessed morphology typical of wild-type virus. It was also observed that deletion of the six accessory genes dramatically affected both the specificity and efficiency of packaging of SIV genomic RNA into virions. However, the presence of both the CTE and the chimeric CMV promoter increased the specificity of viral genomic RNA packaging, while the presence of the IRES augmented packaging efficiency. The Delta6CCI virus was extremely attenuated in replication capacity yet retained infectiousness for CEMx174 and MT4 cells. We also generated constructs that retained either the rev gene or both the rev and vif genes and showed that these viruses, when complemented by the CMV promoter, i.e., Delta5-CMV and Delta4-CMV, were able to replicate in MT4 cells with moderate and high-level efficiency, respectively. Long-term culture of each of these constructs over 6 months revealed no potential for reversion. We hope to shortly evaluate these simplified constructs in rhesus macaques to determine their long-term safety as well as ability to induce protective immune responsiveness as proviral DNA vaccines.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».