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Enregistrement W2008801081 · doi:10.1139/v01-063

Glutathione radical: Intramolecular H abstraction by the thiyl radical

2001· article· en· W2008801081 sur OpenAlexvenueno aff
Arvi Rauk, David A. Armstrong, Jacqueline Bergès

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueFree Radicals and Antioxidants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryIntramolecular forceIsomerizationAmideReaction coordinateTransition stateAb initioStereochemistryComputational chemistryCatalysisOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ab initio computations (B3LYP/6-31G(D)) were used to predict transition structures and energies of activation for intramolecular H atom transfer to a thiyl radical (RS . ) from the α-C—H bonds of glutathione (1) and from the model compounds, N-formylcysteinylglycine (2) and N-(2-thioethanyl)-γ-glutamine (3). For each compound, transition structures were located by in vacuo calculations on the neutral non-zwitterionic system. Thermodynamic functions derived at the same level and single point calculations at the B3LYP/6-311+G(3df,2p) level, were used to derive free energies of activation (ΔG[Formula: see text]) and reaction (ΔG°). For abstraction of the α-C—H (Gly) by the thiyl radical in the gas phase, ΔG[Formula: see text] = 134 kJ mol –1 if the amide link to Gly is in the more stable (Z)-configuration, and ΔG[Formula: see text] = 52 kJ mol –1 if it is in the less stable (E)-configuration. The isomerization of the amide group requires about 95 kJ mol –1 . Previous studies had indicated that for intramolecular reaction of the thiyl radical at α-C—H (Cys), ΔG[Formula: see text] = 110 kJ mol –1 . The lowest energy pathway for intramolecular H-transfer to the thiyl radical is from α-C—H (Gln), ΔG[Formula: see text] = 37–42 kJ mol –1 , and corresponds rather well with experimental results in solution (ΔG[Formula: see text] = 43 kJ mol –1 ). The calculated free energy change for the equilibrium between thiyl and α-C forms of the glutathione radical is ΔG° = –54 kJ mol –1 . The value estimated from experimental data is ΔG° = –37 kJ mol –1 . The agreement between the energies from theory in the gas phase and experiment in solution suggests that the free energies of solvation of reactant thiyl radical, transition structures for H abstraction, and the product α-C-centred radical, are very similar. The effects of solution were estimated by two continuum models (SCIPCM and COSMO). The SCIPCM model yields results very similar to the gas phase, predicting a modest lowering of the activation free energy. The results from the COSMO method were inconclusive as to whether a rate enhancement or decrease could be expected.Key words: glutathione, thiyl radical, α-C-radical, hydrogen transfer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,523
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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