MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2008824680 · doi:10.1128/jb.02346-14

Cj1386, an Atypical Hemin-Binding Protein, Mediates Hemin Trafficking to KatA in Campylobacter jejuni

2014· article· en· W2008824680 sur OpenAlexafffund
Annika Flint, Alain Stintzi

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHeminCampylobacter jejuniBiologyMutantBiochemistryCatalaseMutagenesisHemeEscherichia coliHexacoordinateCampylobacterEnzymeTyrosineMolecular biologyMicrobiologyChemistryBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Catalase enzymes detoxify H2O2 by the dismutation of H2O2 into O2 and H2O through the use of hemin cofactors. While the structure and biochemical properties of catalase enzymes have been well characterized over many decades of research, it remained unclear how catalases acquire hemin. We have previously reported that Cj1386 is essential for ensuring proper hemin content in Campylobacter jejuni catalase (KatA) (A. Flint, Y. Q. Sun, and A. Stintzi, J Bacteriol 194: 334-345, 2012). In this report, an in-depth molecular characterization of Cj1386 was performed to elucidate the mechanistic details of this association. Coimmunoprecipitation assays revealed that KatA-Cj1386 transiently interact in vivo, and UV-visible spectroscopy demonstrated that purified Cj1386 protein binds hemin. Furthermore, hemin titration experiments determined that hemin binds to Cj1386 in a 1:1 ratio with hexacoordinate hemin binding. Mutagenesis of potential hemin-coordinating residues in Cj1386 showed that tyrosine 57 was essential for hemin coordination when Cj1386 was overexpressed in Escherichia coli. The importance of tyrosine 57 in hemin trafficking in vivo was confirmed by introducing the cj1386(Y57A) allele into a C. jejuni Δcj1386 mutant background. The cj1386(Y57A) mutation resulted in increased sensitivity toward H2O2 relative to the wild type, suggesting that KatA was not functional in this strain. In support of this finding, KatA immunoprecipitated from the Δcj1386+cj1386(Y57A) mutant had significantly reduced hemin content compared to that of the cj1386(WT) background. Overall, these findings indicate that Cj1386 is involved in directly trafficking hemin to KatA and that tyrosine 57 plays a key role in this function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,442
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of BacteriologyMême sujetPorphyrin Metabolism and DisordersTravaux en français237 207