Cloning and sequence analysis of 2 different acetylcholinesterase genes in<i>Rhopalosiphum padi</i>and<i>Sitobion avenae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Two genes encoding different acetylcholinesterases (AChE) were successfully cloned from 2 species of aphid, Rhopalosiphum padi (L.) and Sitobion avenae (F.). They were named Rp.AChE1 (GenBank accession No. AY707318), Rp.AChE2 (AY667435), Sa.AChE1 (AY707319), and Sa.AChE2 (AY819704), and were 2133, 2363, 2131, and 2362 bp in length and encoded 664, 676, 664, and 676 amino acids, respectively. All of them shared the characteristics of the AChE family: catalytic tiads, 3 intra-chain disulfide bridges, an acyl pocket, and the conservative aromatic residues for the active site of the gorge. Sequence analysis revealed that Rp.AChE1 and Sa.AChE1 showed higher identity to the reported orthologous genes of Drosophila AChE, and Rp.AChE2 and Sa.AChE2 to paralogous genes. However, in each of the aphids, the 2 genes from the same species shared only 29% identity between one another. It was therefore concluded that each of the aphids has 2 different AChE genes, which are either orthologous or paralogous to Drosophila AChE. The high conservation of AChE1 and AChE2 indicated that 2 acetylcholinesterases exist popularly and that both might function in aphids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».