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Enregistrement W2009002061 · doi:10.1074/jbc.m211224200

Nuclear Localization of a Non-caspase Truncation Product of Atrophin-1, with an Expanded Polyglutamine Repeat, Increases Cellular Toxicity

2003· article· en· W2009002061 sur OpenAlexaff
Frederick C. Nucifora, Lisa Ellerby, Cheryl L. Wellington, Jon D. Wood, W. Joseph Herring, Akira Sawa, Michael R. Hayden, Valina L. Dawson, Ted M. Dawson, Christopher A. Ross

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and Stroke
Mots-clésNuclear localization sequenceBiologyTrinucleotide repeat expansionSpinocerebellar ataxiaNuclear proteinCell nucleusToxicityMolecular biologyCell biologyGeneGeneticsCytoplasmTranscription factorChemistryAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dentatorubral and pallidoluysian atrophy (DRPLA) is an autosomal dominant neurodegenerative disorder similar to Huntington's disease, with clinical manifestations including chorea, incoordination, ataxia, and dementia. It is caused by an expansion of a CAG trinucleotide repeat encoding polyglutamine in the atrophin-1 gene. Both patients and DRPLA transgenic mice have nuclear accumulation of atrophin-1, especially an approximately 120-kDa fragment, which appears to represent a cleavage product. We now show that this is an N-terminal fragment that does not correspond to the previously described caspase-3 fragment, or any other known caspase cleavage product. The atrophin-1 sequence contains a putative nuclear localization signal in the N terminus of the protein and a putative nuclear export signal in the C terminus. We have tested the hypothesis that endogenous localization signals are functional in atrophin-1, and that nuclear localization and proteolytic cleavage contribute to atrophin-1 cell toxicity. In transient cell transfection experiments using a neuroblastoma cell line, full-length atrophin-1 with 26 (normal) or 65 (expanded) glutamines localized to both nucleus and cytoplasm, with no significant difference in toxicity between the normal and mutant proteins. A construct with 65 glutamine repeats encoding an N-terminal fragment (which removes an NES) of atrophin-1 similar in size to the truncation product in DRPLA patient tissue, showed increased nuclear labeling, and an increase in cellular toxicity, compared with a similar fragment with 26 glutamines. Full-length atrophin-1 with 65 polyglutamine repeats and mutations inactivating the NES also yielded increased nuclear localization and increased toxicity. These data suggest that truncation enhances cellular toxicity of the mutant protein, and that the NES is a relevant region deleted during truncation. Furthermore, mutating the NLS in the truncated protein shifted atrophin-1 more to the cytoplasm and eliminated the increased toxicity, consistent with the idea that nuclear localization enhances toxicity. In none of the experiments were inclusions visible in the nucleus or cytoplasm suggesting that inclusion formation is unrelated to cell death. These data indicate that truncation of atrophin-1 may alter its ability to shuttle between the nucleus and cytoplasm, leading to abnormal nuclear interactions and cell toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,402

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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